重庆市畜牧科学院前身是1951年川东行署设立的“川东荣昌种畜场”，经十四次易名九次变更隶属，2006年定名为重庆市畜牧科学院。系公益一类畜牧科研事业单位，是国家生猪技术创新中心牵头建设单位，是国家现代畜牧业科技创新中心、国际合作中心和高级科技人才培养基地。宗旨是开展畜牧科学研究、促进畜牧业发展；职责任务是开展动物遗传育种与繁殖技术研究、动物营养与饲料科学研究、兽医与兽药科学研究、畜产品贮藏与加工技术研究、畜牧养殖环境与工程技术研究、牧草育种与草地生态研究，承担畜牧业科技成果转化工作，开展畜牧科技合作与交流等。
院总部建在我国首个以农牧为特色的国家高新区所在地——重庆市荣昌区，B区位于重庆市渝中区，设有内设机构25个，其中研究所14个；在职职工500余人；是全国文明单位、科技部国际科技合作基地、全国科普教育基地、全国科技特派员先进集体。
人才团队 拥有专业技术人员400余人，其中博士67人、硕士148人，高级职称162人；拥有新世纪百千万人才工程国家级人选、国务院特殊津贴专家、现代农业产业技术体系岗位科学家、全国农业科研杰出人才等拔尖人才70人次；培养创新团队17个，25人在国际国内学术组织担任职务。人才梯队和团队结构日趋完善合理。
平台条件 拥有实验室20000余平方米，试验基地1500余亩；建有国家生猪技术创新中心、动物转基因国际联合研究中心、动物环境与福利化养殖国际研究中心、猪品种遗传改良国家地方联合工程实验室、农业农村部养猪科学重点实验室、人社部博士后科研工作站等公共研发平台和试验基地等76个，创新创业条件能力较强。
科技成果 先后承?？蒲邢钅?749项，其中国家级项目116项，?。ú浚┘断钅?70余项；获得各级各类科技奖励207项，其中国家、?。ú浚┘督崩?37项；授权专利355项，发表学术论文2600余篇，出版论著129部。特别是以第一单位主持的《荣昌猪品种资源保护与开发利用》获国家科技进步奖二等奖，开辟了地方猪种?；ず屠玫男履Ｊ剑辉谛笄菀糯试幢；び胄缕分峙嘤⒏咝а?、重大疫病防控、医用动物培育等技术领域处于国际领跑或并跑水平。
成果转化 科技部授牌的首批农业星创天地“重牧硅谷”获批国家级科技企业孵化器，联建16个分院（所），建有一批农技服务与成果转化示范乡镇，实施骨干企业深度合作、乡村振兴和畜牧科技创新与成果转化精英培养等行动；创新了“科研院所+基层农技推广人员+企业+家庭农场”的新型农技服务推广模式。
交流合作 是“中国畜牧科技论坛”“动物环境与福利化养殖国际研讨会”的发起单位和举办地，国际国内交流合作广泛而深入。